MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 43083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020834	TTAT	2	8	59089	59096	25 %	75 %	0 %	0 %	472335297
1002	NC_020834	T	6	6	59255	59260	0 %	100 %	0 %	0 %	472335297
1003	NC_020834	ATC	2	6	59340	59345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335297
1004	NC_020834	TTA	2	6	59398	59403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335297
1005	NC_020834	ATT	2	6	59430	59435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335297
1006	NC_020834	ATT	2	6	59481	59486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335297
1007	NC_020834	TTA	2	6	59560	59565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335297
1008	NC_020834	ATT	2	6	59643	59648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335297
1009	NC_020834	TTG	2	6	59662	59667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335297
1010	NC_020834	ATT	2	6	59775	59780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335297
1011	NC_020834	CA	3	6	59787	59792	50 %	0 %	0 %	50 %	472335297
1012	NC_020834	GTC	2	6	59842	59847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335297
1013	NC_020834	A	6	6	59946	59951	100 %	0 %	0 %	0 %	472335297
1014	NC_020834	ACA	2	6	60106	60111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335297
1015	NC_020834	CAT	2	6	60140	60145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335297
1016	NC_020834	AAT	2	6	60209	60214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335297
1017	NC_020834	TGCT	2	8	60246	60253	0 %	50 %	25 %	25 %	472335297
1018	NC_020834	TTG	2	6	60331	60336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335297
1019	NC_020834	A	6	6	60360	60365	100 %	0 %	0 %	0 %	472335297
1020	NC_020834	TCA	2	6	60400	60405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335297
1021	NC_020834	AAT	2	6	60439	60444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335297
1022	NC_020834	C	6	6	60477	60482	0 %	0 %	0 %	100 %	472335297
1023	NC_020834	ATT	3	9	60483	60491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335297
1024	NC_020834	CAA	2	6	60494	60499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335297
1025	NC_020834	CAT	2	6	60512	60517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335297
1026	NC_020834	TGT	2	6	60564	60569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335297
1027	NC_020834	CCA	2	6	60590	60595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335297
1028	NC_020834	TTG	2	6	60807	60812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335297
1029	NC_020834	CAG	2	6	60851	60856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335297
1030	NC_020834	TCA	2	6	60929	60934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335297
1031	NC_020834	TTCA	2	8	60940	60947	25 %	50 %	0 %	25 %	472335297
1032	NC_020834	CA	3	6	60969	60974	50 %	0 %	0 %	50 %	472335298
1033	NC_020834	GCCA	2	8	61049	61056	25 %	0 %	25 %	50 %	472335298
1034	NC_020834	ATC	2	6	61085	61090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335298
1035	NC_020834	A	6	6	61112	61117	100 %	0 %	0 %	0 %	472335298
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1037	NC_020834	TGT	2	6	61526	61531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335299
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1039	NC_020834	CTT	2	6	61617	61622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335299
1040	NC_020834	TTG	2	6	61633	61638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335299
1041	NC_020834	GAG	2	6	61643	61648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335299
1042	NC_020834	TCT	2	6	61784	61789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335299
1043	NC_020834	GCT	2	6	61826	61831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335299
1044	NC_020834	TGGC	2	8	61932	61939	0 %	25 %	50 %	25 %	472335299
1045	NC_020834	GCA	2	6	61952	61957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335299
1046	NC_020834	CTG	2	6	61959	61964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335299
1047	NC_020834	TCA	2	6	61983	61988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335299
1048	NC_020834	GGCTC	2	10	62200	62209	0 %	20 %	40 %	40 %	472335299
1049	NC_020834	CGG	2	6	62225	62230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335299
1050	NC_020834	GCT	2	6	62282	62287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335299
1051	NC_020834	TGC	2	6	62293	62298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335299
1052	NC_020834	T	6	6	62319	62324	0 %	100 %	0 %	0 %	472335299
1053	NC_020834	CGCT	2	8	62329	62336	0 %	25 %	25 %	50 %	472335299
1054	NC_020834	CGG	2	6	62358	62363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335299
1055	NC_020834	T	6	6	62432	62437	0 %	100 %	0 %	0 %	472335299
1056	NC_020834	CGG	2	6	62650	62655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335300
1057	NC_020834	T	6	6	62777	62782	0 %	100 %	0 %	0 %	472335301
1058	NC_020834	TCAA	2	8	62801	62808	50 %	25 %	0 %	25 %	472335301
1059	NC_020834	AGT	2	6	62814	62819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335301
1060	NC_020834	TGC	2	6	62891	62896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335301
1061	NC_020834	ATT	2	6	63080	63085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335301
1062	NC_020834	GTTGA	2	10	63105	63114	20 %	40 %	40 %	0 %	472335302
1063	NC_020834	GTA	2	6	63163	63168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335302
1064	NC_020834	CAAT	2	8	63247	63254	50 %	25 %	0 %	25 %	472335302
1065	NC_020834	GA	3	6	63289	63294	50 %	0 %	50 %	0 %	472335302
1066	NC_020834	AAGT	2	8	63539	63546	50 %	25 %	25 %	0 %	472335303
1067	NC_020834	CAC	2	6	63562	63567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335303
1068	NC_020834	TAA	2	6	63568	63573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335303
1069	NC_020834	AAACGC	2	12	63692	63703	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	472335303
1070	NC_020834	TGG	2	6	63747	63752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335303
1071	NC_020834	TCA	2	6	63773	63778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335303
1072	NC_020834	GTA	2	6	63803	63808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335303
1073	NC_020834	CCA	2	6	63837	63842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335303
1074	NC_020834	TCT	2	6	63962	63967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335304
1075	NC_020834	TTG	2	6	63987	63992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335304
1076	NC_020834	CAC	2	6	63993	63998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335304
1077	NC_020834	CT	3	6	64036	64041	0 %	50 %	0 %	50 %	472335304
1078	NC_020834	TG	3	6	64090	64095	0 %	50 %	50 %	0 %	472335304
1079	NC_020834	CAAC	2	8	64140	64147	50 %	0 %	0 %	50 %	472335304
1080	NC_020834	GCACG	2	10	64160	64169	20 %	0 %	40 %	40 %	472335304
1081	NC_020834	ATC	2	6	64189	64194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335304
1082	NC_020834	GCCT	2	8	64221	64228	0 %	25 %	25 %	50 %	472335304
1083	NC_020834	CAG	2	6	64322	64327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335304
1084	NC_020834	ACC	2	6	64412	64417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335304
1085	NC_020834	CAC	2	6	64419	64424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335304
1086	NC_020834	GTT	2	6	64451	64456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335304
1087	NC_020834	CAG	2	6	64520	64525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335304
1088	NC_020834	GAA	2	6	64526	64531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335304
1089	NC_020834	CGC	2	6	64601	64606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335304
1090	NC_020834	TTA	2	6	64800	64805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335305
1091	NC_020834	CTG	2	6	64840	64845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335305
1092	NC_020834	GCCCA	2	10	64849	64858	20 %	0 %	20 %	60 %	472335305
1093	NC_020834	T	6	6	64991	64996	0 %	100 %	0 %	0 %	472335305
1094	NC_020834	TC	3	6	65031	65036	0 %	50 %	0 %	50 %	472335305
1095	NC_020834	T	7	7	65044	65050	0 %	100 %	0 %	0 %	472335305
1096	NC_020834	AGAA	2	8	65283	65290	75 %	0 %	25 %	0 %	472335306
1097	NC_020834	A	6	6	65304	65309	100 %	0 %	0 %	0 %	472335306
1098	NC_020834	TGGC	2	8	65452	65459	0 %	25 %	50 %	25 %	472335306
1099	NC_020834	AG	3	6	65509	65514	50 %	0 %	50 %	0 %	472335306
1100	NC_020834	A	6	6	65528	65533	100 %	0 %	0 %	0 %	472335306
1101	NC_020834	TGA	2	6	65538	65543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335306
1102	NC_020834	CAG	2	6	65585	65590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335306
1103	NC_020834	CTG	2	6	65653	65658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335306
1104	NC_020834	GCG	2	6	65687	65692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335306
1105	NC_020834	GTG	2	6	65777	65782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335306
1106	NC_020834	AATT	2	8	65858	65865	50 %	50 %	0 %	0 %	472335306
1107	NC_020834	CCG	2	6	65900	65905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335306
1108	NC_020834	AAG	2	6	65906	65911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335306
1109	NC_020834	ATC	2	6	65926	65931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335306
1110	NC_020834	CTC	2	6	66221	66226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335307
1111	NC_020834	TTAC	2	8	66236	66243	25 %	50 %	0 %	25 %	472335307
1112	NC_020834	TAA	2	6	66274	66279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335307
1113	NC_020834	CA	3	6	66280	66285	50 %	0 %	0 %	50 %	472335307
1114	NC_020834	CAA	2	6	66299	66304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335307
1115	NC_020834	ATT	2	6	66311	66316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335307
1116	NC_020834	ACG	2	6	66459	66464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335307
1117	NC_020834	AC	3	6	66468	66473	50 %	0 %	0 %	50 %	472335307
1118	NC_020834	TTG	2	6	66489	66494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335307
1119	NC_020834	TAA	2	6	66640	66645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335307
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1121	NC_020834	AAAAG	2	10	66712	66721	80 %	0 %	20 %	0 %	472335307
1122	NC_020834	GAT	2	6	66767	66772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335307
1123	NC_020834	AACA	2	8	66817	66824	75 %	0 %	0 %	25 %	472335307
1124	NC_020834	ATT	2	6	66844	66849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335307
1125	NC_020834	AG	3	6	66904	66909	50 %	0 %	50 %	0 %	472335308
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1127	NC_020834	CTT	2	6	67266	67271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335309
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1236	NC_020834	A	6	6	73647	73652	100 %	0 %	0 %	0 %	472335316
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1239	NC_020834	ACC	2	6	73865	73870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335316
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1243	NC_020834	CAA	2	6	74062	74067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335316
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1246	NC_020834	TTA	2	6	74215	74220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335316
1247	NC_020834	TTAA	2	8	74248	74255	50 %	50 %	0 %	0 %	472335316
1248	NC_020834	GCA	2	6	74276	74281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335316
1249	NC_020834	AATT	2	8	74336	74343	50 %	50 %	0 %	0 %	472335316
1250	NC_020834	T	6	6	74364	74369	0 %	100 %	0 %	0 %	472335316
1251	NC_020834	A	6	6	74605	74610	100 %	0 %	0 %	0 %	472335317
1252	NC_020834	CTTT	2	8	74620	74627	0 %	75 %	0 %	25 %	472335317
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